環境保護研究所成立於2011年10月，取得企業清潔生產審核資質，結合專業教學，在環境影響評價、企業突發環境事件應急預案編製、環境監測與預警等環境管理實務中較好地完成過企事業橫向委托項目。

近年來，以該平台為支撐，相關科研人員取得環境損害司法鑒定資質。目前正主持福建省重大項目1項。