海洋研究院成立於2018年6月，設立了海洋智能裝備開發、海洋生物資源開發、海岸帶生態修複3個研究方向。

先後完成並驗收通過了《福建省海岸帶生態修複技術創新平台》《漁業資源監測機器人係統開發及在海洋牧場管理中的應用》2個重大項目，目前正主持《小球藻胞外聚合物對紡織類微塑料PAN的響應及其機理》和《基於AI的海洋水下聲光聯合魚類識別方法研究及軟件係統研發》等福建省自然科學基金項目。儲備項目10餘項。促進海洋資源與環境專業崛起，更好服務福建省現代漁業千億級產業集群高質量發展。